随着益生菌作为健康补品的出现，将肠道细菌称为“好”细菌或“坏”细菌已成为普遍现象。 根据《哈佛医学院家庭健康指南》，每个人的肠道内平均携带约100万亿细菌。 “好”细菌在肠道中执行许多必要的功能。 只要数量不多，某些“坏”细菌就不会造成任何问题，但如果它们繁殖或传播到身体的其他部位，则可能使您感到不适。
击败坏细菌
好的细菌可以通过多种方式阻止坏细菌繁殖并引起疾病。 它们会消耗掉营养素，从而使有害细菌无法获取营养素。 乳杆菌主要存在于小肠中，而双歧杆菌主要存在于大肠中，通过产生乳酸，过氧化氢和乙酸来维持肠中的酸性环境。 酸性环境会阻止有害细菌的生长。 好的细菌还可以增强粘在肠内的粘膜组织，使毒素更难以获得立足点并占据体内。
消化营养
食物的消化取决于好细菌的作用，好细菌会分解复杂的糖，蛋白质和脂肪，使您的身体能够吸收它们的能量。 乳杆菌是在小肠中发现的主要微生物，它分解乳制品中的蛋白质和乳糖以及胆固醇以吸收。
合成维生素
一些细菌还合成维生素。 嗜酸乳杆菌可生产维生素K。乳酸菌可产生一些B复合维生素，而肠溶菌可产生维生素B-12。
协助免疫系统
好的细菌在支持免疫系统中起着强大的作用。 一种干酪乳杆菌干酪乳杆菌可产生细菌素，这种化合物可限制有害细菌在小肠中的生长。 好的细菌会增加称为T细胞的白细胞，这有助于免疫系统对有害细菌的反应。 退伍军人管理局Puget Sound卫生保健系统进行的一项现有研究的一项综述，该研究发表在2006年4月的《美国胃肠病学杂志》上，发现服用益生菌（由“好”细菌组成）可以缩短腹泻后的腹泻时间抗生素管理和艰难梭菌感染。
