免疫系统负责保护人体免受疾病和其他病原体（包括病毒，细菌和寄生虫）的入侵。 免疫系统也参与对创伤的正常愈合反应，以预防感染。 尽管身体是一个整体，并且所有系统在某种程度上都可以协同工作，但与免疫系统协同工作的主要身体系统是淋巴，循环系统，肌肉骨骼系统和消化系统。
胸腺
胸腺是专门的器官，是免疫系统的一部分。 胸腺位于胸骨下方，仅在年轻人中活跃。 可以将其视为成熟细胞的免疫训练场，免疫细胞学会将其与自身区别开来。
淋巴系统
人体通过淋巴系统将液体输送到血液和循环系统之外。 淋巴是免疫细胞和免疫信号循环的主要途径。 它包含成千上万的淋巴结，免疫细胞在其中采样并对入侵的病原体做出反应。 扁桃体，阑尾和肠道相关淋巴组织（GALT）与淋巴结相似，是人体用来发展和调节免疫反应的更专门的器官。
循环系统
循环系统由血管和心脏组成，是免疫细胞通过人体传播的主要途径。
肌肉骨骼系统
通过肌肉的运动，淋巴液在整个身体中移动。 这是定期运动对健康的免疫功能至关重要的主要原因之一。 人体长而扁平的骨髓是血液（包括免疫细胞）在进入循环和淋巴系统之前生长并成熟的地方。
消化系统
消化系统对适当的免疫功能至关重要。 GALT（包括扁桃体和阑尾）是人体识别哪些异物是食物和哪些病原体的位置，有助于建立正常的免疫功能。
其他系统
除了四个主要系统，呼吸系统，神经系统和内分泌系统还高度参与免疫功能。 肺与免疫系统与病原体的接触密切相关，并且像消化系统一样，具有大量的免疫组织。 神经和内分泌系统与免疫系统共享许多相同的信号化学物质，并且与免疫系统一起对于人体的平衡和体内平衡（维持内部平衡的能力）至关重要。
