接触污水后，细菌，病毒，藻类和原生动物感染很常见。 如果污水或废水处理设施不足或负担过重，在发达地区附近的池塘，湖泊和海洋中游泳可能会增加您受到废水污染的风险。 游泳后，特别是在美国以外的地方，发烧后应立即看医生。
钩端螺旋体病
钩端螺旋体病是由钩端螺旋体状的钩端螺旋体属细菌引起的感染，该细菌通过受影响哺乳动物的粪便和尿液传播，其特征是发烧，发冷和剧烈头痛。 柏林罗伯特·科赫研究所的研究人员在海德堡郊外的内卡河上完成了游泳比赛的一部分后，在铁人三项运动员中发现了一例钩端螺旋体病。 医疗队试图联系所有参与者，以确定可能爆发的风险。 在回应的142位参与者中，有5例被确认。 作者说，事件发生前的大雨很可能导致水污染，而开放的伤口可能是细菌进入的地方。
脑膜炎
肠病毒是肠道寄生虫，可通过人类粪便污染水，并引起多种疾病，包括脑膜炎，脑部和脊髓发炎，突然发烧，瘫痪和精神状态改变。 2008年9月期《临床传染病》中的一篇文章描述了从墨西哥之旅返回的一个学校团体中病毒性脑膜炎的爆发。 在这29名旅客中，有21名在墨西哥湾长时间游泳四天后患病。 测试结果证实了病毒性脑膜炎，统计分析表明，游泳时间与感染的发生呈正相关。 研究人员得出结论，该小组很可能在污水污染的海水中游泳。
藻类毒性
Lyngbya majuscule是一种藻类，会在热带海水中开花并释放出毒素，这些毒素会导致以皮疹，肠胃不适，头痛和发烧为特征的疾病。 2003年4月，在《环境国际》上的一篇文章评估了藻类开花期间澳大利亚摩尔顿湾游泳者的健康状况。 研究人员邮寄了5000张居民娱乐水活动和疾病发生情况调查表。 在1350位受访者中，有78％的人报告说花在开花时在水中，而34％的人说的是一种或多种症状，最常见的是皮肤刺激。 尽管有相当多的受访者报告了藻类中毒症状，但只有29名是严重的。
原生动物感染
2005年4月出版的《泰国医学协会杂志》上的一项研究报告说，有一例男子抱怨鼻涕持续低热，发烧，头痛和流血粘液持续一周。 医生发现他在症状发作前两到三天曾在天然池塘里游泳。 鼻腔分泌物的显微镜检查显示存在两种带鞭毛的变形虫：内格氏菌和棘阿米巴菌。 作者得出的结论是，这是第一例活病人体内双重感染自由活动变形虫的报道。
