益生菌粉
发酵食品有助于恢复肠道中适当的细菌平衡。 大多数益生菌是一组乳酸菌的组成部分，它们存在于酸奶，发酵乳和其他发酵食品中。 2006年6月在“应用微生物学杂志”上发表的一篇文章指出，食用含有乳酸菌的食物可改善肠道健康，提高营养素的生物利用度，减少乳糖不耐症的症状，并降低易感人群的过敏症患病率。
心脏健康
尽管大多数人将食用乳制品与罹患冠心病的风险联系在一起，但某些发酵乳产品实际上可能具有有益心脏健康的特性。 2006年2月发表在“脂质学最新观点”上的一篇文章指出，有证据表明，发酵乳制品对异常高血压（被称为高血压）的影响略有下降。 文章敦促进一步检查奶酪对冠心病危险因素的影响。
增强免疫系统
吃发酵食品会使肠道不易患肠道疾病，并增强免疫系统。 例如，开菲尔（kefir）是一种通过将牛奶与某些谷物发酵而制成的浓稠酸性饮料，不仅易于消化，而且还可以通过有益的微生物在肠道内定殖，从而帮助维持健康的免疫反应。 据联合国大学称，开菲尔已被用于治疗肺结核，癌症和肺结核。
胃癌的缺点
虽然研究表明了发酵食品的许多好处，但仍存在一些担忧。 2011年1月发表在《癌症科学》上的一篇文章对关于食用发酵和非发酵大豆食品对患胃癌风险的影响的报告进行了荟萃分析。 研究发现，高摄入发酵大豆食品与患胃癌的风险显着相关，而高发酵大豆食品的饮食对降低胃癌的风险很重要。
