碳水化合物，脂肪和蛋白质的消化主要发生在小肠中，其产物进入血液或淋巴系统。 消化和吸收在小肠内以非常有序的方式发生，并且涉及细胞用来加速反应的许多酶或蛋白质的帮助。
小肠
小肠分为三个部分：十二指肠，空肠和回肠。 加州大学医学院的医学教授金·巴雷特（Kim Barrett）博士指出，十二指肠大约长12英寸。 第一部分调节消化，胰腺和胆囊都有分泌物进入其中。 下一部分是8英尺的空肠，其中大部分吸收发生在空肠中。 回肠，或最后一节，长12英尺。
十二指肠的消化酶
如Barrett博士所述，碳水化合物的消化从唾液中的酶开始在口腔中进行。 它与十二指肠内的淀粉酶一起从胰腺分泌到十二指肠内。 另外，肠细胞使用蔗糖酶，麦芽糖酶和乳糖酶。 脂肪通过胰酶分泌的脂肪酶分解。 蛋白质消化从胃开始。 在十二指肠中，来自胰脏的胰蛋白酶和肠肽酶会继续这一过程。
空肠的消化酶
碳水化合物和脂肪的消化在空肠的上部或小肠的第二部分完成，而大部分碳水化合物和脂肪的吸收发生在十二指肠和空肠，医学博士Andrew Shelton博士建议斯坦福大学医学院的外科。 空肠的主要目的是吸收营养，这就是为什么它具有称为绒毛和微绒毛的特殊结构的原因。 空肠也吸收大多数蛋白质。
回肠
回肠的主要功能是吸收，尤其是胆汁酸，脂溶性维生素和维生素B-12。 在肝脏中产生的胆汁有助于分解脂肪。 当回肠吸收胆汁酸时，它通过血液将其发送到肝脏，成为胆汁的一部分。 溶于脂肪的脂溶性维生素是维生素D，A，K和E。因此，回肠的破坏或手术清除会导致吸收脂溶性维生素和维生素B-2的问题，如Atenodoro所述医学博士鲁伊斯（Ruiz，Jr.），在“默克医疗保健专业人员手册”中。
