当香烟烟雾通过过滤器时，会留下黑色的粘稠物质，称为焦油。 吸烟者吸入的焦油的确切成分尚不确定。 任何一种植物材料都是名副其实的复杂化学物质的酿造。 燃烧以不可预测的方式使烟叶中的这些化合物发生转化，而吸入烟气的最终成分则取决于确切的吸烟方式。 虽然很难确切确定焦油中的成分，但很明显，它会导致烟草对健康的大部分有害影响。
肺癌
肺癌是吸烟引起的最著名疾病之一。 通常在焦油中发现的一些已知致癌物包括苯，丙烯酰胺和丙烯腈。 吸烟使肺内的脆弱细胞直接暴露于这些化合物，从而导致细胞DNA发生突变并导致癌症。 根据世界卫生组织关于“烟草烟雾和非自愿吸烟”的报告，所有肺癌病例中有90％归因于吸烟。
气肿
肺气肿是一种疾病，其中复杂的蜂窝状空气通道和肺部内部的蜂窝破裂，导致大的露天空间。 这些大空间几乎不吸收空气以及原始肺组织的氧气，这会导致呼吸急促。 将空气从受损的肺组织中排出也更加困难，这导致呼气的努力增加。 焦油中的化合物会引起肺部炎症，从而激活免疫系统的细胞。 随着时间的流逝，这些免疫细胞的持续活性会导致肺组织和肺气肿的破裂。
心脏病
与不吸烟者相比，吸烟者患冠状动脉疾病的比率要高得多。 这种增加的风险的一部分归因于香烟中的尼古丁，但是焦油也起着重要作用。 焦油中的某些化合物通过肺部吸收并进入血液。 一旦到达那里，它们就会促进血液中胆固醇的化学转化，使胆固醇更有可能在包括冠状动脉在内的动脉壁上形成斑块。 因此，吸烟和高胆固醇是CAD的倍增危险因素。 两者在一起要比分别拥有它们的总和差得多。
