鱼油和亚麻籽油提供大量的必需脂肪酸。 鱼油含有二十碳五烯酸-EPA-和二十二碳六烯酸-DHA-直接用于产生健康细胞膜和减轻炎症等功能。 亚麻籽油中含有α亚麻酸-ALA-人体可将其转化为EPA和DHA。 亚麻籽油和鱼油在降低胆固醇方面的相对优点是一个不断发展的故事，受到了很多研究和广泛关注。
炎
2009年2月在《心血管研究》杂志上发表的一项研究表明，鱼油比亚麻籽油能减轻炎症并显示出更好的心脏保护作用。 在对实验动物的研究中，含有0.7％，2.3％或7％的鱼油或亚麻籽油的饮食可改善心脏左心室的心脏功能，从而将血液泵送到人体，并降低某些炎症标志物的水平。 鱼油还增加了抗炎激素脂联素的产生。
总胆固醇
在一项将亚麻籽油，橄榄油，鱼油和豆油进行比较的研究中，鱼油比其他油所产生的总胆固醇，高密度脂蛋白胆固醇和甘油三酸酯含量更低。 亚麻籽油产生较少的白细胞活化，这被认为与动脉斑块形成有关。 关于实验动物的研究发表在2010年6月的杂志“ Acta Chirurgica Brasileira”上。
动脉粥样硬化
根据2010年7月“脂质研究杂志”上发表的一项研究，鱼油比亚麻籽油更好地预防了动脉粥样硬化。 在对实验动物的研究中，含有两种水平的亚麻籽或鱼油的饮食16周导致鱼油组的LDL胆固醇水平低于亚麻籽组。 尽管两种油都降低了某些引起牙菌斑的化合物的含量，但鱼油的效率却提高了23％。
效率
根据2010年9月在《脂质》杂志上发表的一项研究，要获得亚麻籽油的心脏保护作用，您必须消耗的亚麻籽油是鱼油的33.5倍。 在对实验动物的研究中，将含有2.5％，5％，10％或25％亚麻籽油的饮食与含有1％，2.5％，5％的鱼油的饮食进行了比较。 亚麻籽中的100毫克α-亚麻酸在心脏中产生0.7％的EPA和DHA，而鱼油中100毫克的EPA和DHA在心脏组织中产生24％的EPA和DHA浓度。 研究人员得出结论，亚麻籽对心血管健康的保护作用比鱼油低。
甘油三酸酯
马里兰大学医学中心建议使用鱼油来减少甘油三酸酯，但要注意，鱼油可能会导致HDL和LDL胆固醇含量略有上升。 鱼油已成功与红曲米（一种具有降低胆固醇能力的发酵米）结合使用，与标准他汀类药物相似，可降低胆固醇水平。 相反，亚麻籽油可能不会降低LDL或甘油三酸酯的含量，并且亚麻籽油的许多研究都显示出相互矛盾的结果。
