巧克力中的主要成分是可可豆，可可豆生长在南美的雨林中。 大多数商业巧克力都经过烘烤过程。 未经加工的生巧克力尚未烘焙，因此生巧克力的消费者正在吃生可可和一些其他食材以将其粘合在一起。 尽管生巧克力富含维生素C以及矿物质（例如镁和铁），但对健康有不利影响。
咖啡因不安
像咖啡豆一样，可可豆也含有咖啡因。 在未加工的巧克力中，咖啡因含量高于经过加工的烘焙巧克力。 咖啡因会增加许多消费者的焦虑水平，并加快心率。 它提供了短暂的能量爆发，通常伴随着能量水平的显着下降。 睡前食用生巧克力的人可能难以入睡。 另外，咖啡因是一种成瘾物质。 习惯于通过巧克力消费咖啡因的消费者可能需要相应地进食较大量的食物，以免摄入咖啡因而使人昏昏欲睡。
不卫生成分
根据整体自助作者辛西娅·珀金斯（Cynthia Perkins）的说法，巧克力通常含有昆虫和啮齿动物粪便的痕迹。 美国食品和药物管理局（Food and Drug Administration）在每个巧克力棒上最多允许16个昆虫碎片和一只啮齿动物毛发。 每磅可可豆还可以吸收10毫克的啮齿动物粪便，每三汤匙的巧克力粉可以吸收75片昆虫碎片。 商业巧克力烘焙过程消除了大多数疾病和寄生虫，这些疾病和寄生虫可能会通过这些微量的不卫生有机物传播，但生巧克力的消费者更容易受到不利影响。
对狗的毒性
在线杂志《狗主人的摘要》（Dog Owner's Digest）称，一种名为可可碱的兴奋剂的存在使巧克力对狗有毒。 可可碱天然存在于可可豆中，并影响狗的中枢神经系统。 食用过多巧克力的狗会出现呕吐，排尿过多或活动过度等症状。 更严重的症状包括心律不齐，癫痫发作和死亡。 可可含量在生巧克力中比在牛奶巧克力中更集中，因此几克生巧克力对狗的危害要比同等量的牛奶巧克力更为危险。
致幻作用
营养学家和作家弗雷德里克·帕特纳德（Frederic Patenaude）表示，极高剂量的生可可可产生类似于LSD的致幻作用。 尽管普通人必须消耗约40种苦可可豆才能感觉到这种效果，但这并不是一个例外的数量。 根据加利福尼亚艺术与科学学院的报告，该学院于2005年举办了一次纪念巧克力的展览，据此，只需30至50个可可豆就可以生产7个牛奶巧克力条或2个黑巧克力条。
